- Класс Petromyzontida (Миноги)
- Отряд Petromyzontiformes (Миногообразные)
- Класс Chondrichthyes (Хрящевые)
- Отряд Carcharhiniformes (Кархаринообразные)
- Отряд Pristiformes (Пилоносообразные)
- Отряд Rajiformes (Скатообразные)
- Отряд Myliobatiformes (Хвостоколовые)
- Класс Actinopterygii (Лучеперые)
- Отряд Polypteriformes (Многоперообразные)
- Отряд Acipenseriformes (Осетрообразные)
- Отряд Lepisosteiformes (Панцирникообразные)
- Отряд Amiiformes (Амиеобразные)
- Класс Sarcopterygii (Лопастеперые или четвероногие)
- Отряд Ceratodontiformes (Рогозубообразные)
- Класс Teleostei (Костистые)
- Отряд Acanthuriformes (Аккантуриобразные)
- Отряд Acropomatiformes (Акропоматообразные)
- Отряд Anabantiformes (Анабасообразные)
- Отряд Anguilliformes (Угреообразные)
- Отряд Atheriniformes (Атеринообразные)
- Отряд Batrachoidiformes (Жабообразные)
- Отряд Beloniformes (Сарганообразные)
- Отряд Blenniiformes (Собачкообразные)
- Отряд Callionymiformes (Каллионимообразные)
- Отряд Carangiformes (Карангообразные)
- Отряд Centrarchiformes (Центрархообразные)
- Отряд Cichliformes (Цихлидообразные)
- Отряд Characiformes (Харацинообразные)
- Отряд Clupeiformes (Сельдеобразные)
- Отряд Cypriniformes (Карпообразные)
- Отряд Cyprinodontiformes (Карпозубоообразные)
- Отряд Elopiformes (Тарпонообразные)
- Отряд Esociformes (Щукообразные)
- Отряд Hiodontiformes (Луноглазообразные)
- Отряд Gadiformes (Трескообразные)
- Отряд Gasterosteiformes (Колюшкообразные)
- Отряд Gobiesociformes (Присоскообразные)
- Отряд Gobiiformes (Бычковидные)
- Отряд Gonorynchiformes (Гоноринхообрзные)
- Отряд Gymnotiformes (Гимнотообразные)
- Отряд Kurtiformes (Куртиобразные)
- Отряд Mugiliformes (Кефалеобразные)
- Отряд Ophidiiformes (Офидиеобразные)
- Отряд Osmeriformes (Корюшкообразные)
- Отряд Osteoglossiformes (Арованообразные)
- Отряд Perciformes (Окунеобразные)
- Отряд Percopsiformes (Перкопсообразные)
- Отряд Pleuronectiformes (Камбалообразные)
- Отряд Salmoniformes (Лососеобразные)
- Отряд Scombriformes (Скумбриобразные)
- Отряд Scorpaeniformes (Скорпенообразные)
- Отряд Siluriformes (Сомообразные)
- Отряд Synbranchiformes (Слиткожаберниковые)
- Отряд Tetraodontiformes (Четырехзубообразные)
Класс Petromyzontida (Миноги)
Отряд Petromyzontiformes (Миногообразные)
- Семейство Petromyzontidae (Миноговые)
- Семейство Geortiidae (Геортидовые)
- Семейство Mordaciidae (Мордациевые)
Класс Chondrichthyes (Хрящевые)
Отряд Carcharhiniformes (Кархаринообразные)
- Семейство Carcharhinidae (Кархариновые)
- Семейство Triakidae (Куньи акулы)
Отряд Pristiformes (Пилоносообразные)
- Семейство Pristidae (Пилоносые)
Отряд Rajiformes (Скатообразные)
- Семейство Rhinobatidae (Гитарные скаты)
Отряд Myliobatiformes (Хвостоколовые)
- Семейство Dasyatidae (Южные хвостоколы)
- Семейство Potamotrygonidae (Американские хвостоколы)
Класс Actinopterygii (Лучеперые)
Отряд Polypteriformes (Многоперообразные)
- Семейство Polypteridae (Многоперовые)
Отряд Acipenseriformes (Осетрообразные)
- Семейство Acipenseridae (Осетровые)
- Семейство Polyodontidae (Веслоносые)
Отряд Lepisosteiformes (Панцирникообразные)
- Семейство Lepisosteidae (Панцирниковые)
Отряд Amiiformes (Амиеобразные)
- Семейство Amiidae (Амиевые)
Класс Sarcopterygii (Лопастеперые или четвероногие)
Отряд Ceratodontiformes (Рогозубообразные)
- Семейство Ceratodontidae (Рогозубые или австралийские однолегочники)
- Семейство Lepidosirenidae (Лепидосиреновые или американские двухлегочники)
- Семейство Protopteridae (Протоптеридовые или африканские двухлегочники)
Класс Teleostei (Костистые)
Отряд Acanthuriformes (Аккантуриобразные)
- Семейство Drepanidae (Дрепановые)
- Семейство Lobotidae (Трехвостковые)
- Семейство Scatophagidae (Скатофаговые)
Отряд Acropomatiformes (Акропоматообразные)
- Семейство Lateolabracidae (Латеолабраксовые)
Отряд Albuliformes (Альбулообразные)
- Семейство Albulidae (Альбуловые)
Отряд Anabantiformes (Анабасообразные)
- Семейство Aenigmachannidae (Аенигмаханидовые)
- Семейство Anabatidae (Анабасовые)
- Семейство Channidae (Змееголовые)
- Семейство Helostomatidae (Хелостомовые)
- Семейство Nandidae (Нандовые)
- Семейство Osphronemidae (Лабиринтовые)
Отряд Anguilliformes (Угреообразные)
- Семейство Anguillidae (Угревидные)
- Семейство Moringuidae (Моринговые)
- Семейство Muraenesocidae (Муреноподобные)
- Семейство Muraenidae (Муреновые)
- Семейство Ophichthydae (Офихтивые)
Отряд Atheriniformes (Атеринообразные)
- Семейство Atherinidae (Атериновые)
- Семейство Atherinopsoidae (Атериновидные)
- Семейство Melanotaeniidae (Меланотеневые)
- Семейство Phallostethidae (Твердоголовые)
- Семейство Psudomugilidae (Псевдомугиловые)
Отряд Batrachoidiformes (Жабообразные)
- Семейство Batrachoididae (Жабовидные)
Отряд Beloniformes (Сарганообразные)
- Семейство Adrianichthyidae (Оризиевые)
- Семейство Belonidae (Саргановые)
- Семейство Hemiramphidae (Полурылые)
Отряд Blenniiformes (Собачкообразные)
- Семейство Blenniidae (Собачковые)
Отряд Callionymiformes (Каллионимообразные)
- 1.Семейство Callionymidae (Каллионимовые)
-
Отряд Carangiformes (Карангообразные)
- Семейство Carangidae (Каранговые)
Отряд Centrarchiformes (Центрархообразные)
- Семейство Centrarchidae (Центрарховые или ушастые окуни)
- Семейство Elassomatidae (Элассомовые)
- Семейство Percichthyidae (Перцихтовые)
- Семейство Perciliidae (Перцилиевые)
- Семейство Sinipercidae (Синиперковые)
- Семейство Terapontidae (Терапоновые)
Отряд Cichliformes (Цихлидообразные)
- Семейство Cichlidae (Цихловые)
Отряд Characiformes (Харацинообразные)
- Семейство Acestrorhynchidae (Ацестроринховые)
- Семейство Alestiidae (Аоестовые)
- Семейство Anostomidae (Узкоротые)
- Семейство Bryconidae (Бриконовые)
- Семейство Chalceidae (Хальцидовые)
- Семейство Characidae (Харацидовые)
- Семейство Chilodontidae (Хилодонтовые)
- Семейство Citharinidae (Цитариновые)
- Семейство Crenuchidae (Кренуховые)
- Семейство Ctenolucidae (Щуковидные)
- Семейство Curimatidae (Куриматовые)
- Семейство Cynodontidae (Саблезубые)
- Семейство Distichodontidae (Дистиходовые)
- Семейство Erythrinidae (Эритриновые)
- Семейство Gasteropelecidae (Клинобрюхие)
- Семейство Hemiodontidae (Полузубые)
- Семейство Hepsetidae (Хепсетовые)
- Семейство Iguanodectidae (Игуанодектовые)
- Семейство Lebiasinidae (Пиррулиновые)
- Семейство Parodontidae (Пародонтовые)
- Семейство Prochilodontidae (Прохилодовые)
- Семейство Serrasalminidae (Пираньевые)
- Семейство Tarumaniidae (Таруманиевые)
- Семейство Triportheidae (Трипортеевые)
Отряд Clupeiformes (Сельдеобразные)
- Семейство Clupeidae (Сельдевые)
- Семейство Denticipidae (Дентицидиевые)
- Семейство Engraulidae (Анчоусовые)
- Семейство Pristigasteridae (Пристигастериевые)
- Семейство Sundasalangidae (Сандасаланговые)
Отряд Cypriniformes (Карпообразные)
- Семейство Acheilognathidae (Горчаковые)
- Семейство Ballitoridae (Балиторовые)
- Семейство Barbuccidae (Барбуковые)
- Семейство Botiidae (Боциевые)
- Семейство Catostomidae (Чукучановые)
- Семейство Cobitidae (Вьюновые)
- Семейство Cyprinidae (Карповые)
- Семейство Danionidae (Даниевые)
- Семейство Ellopostomidae (Эллопостовые)
- Семейство Gastromyzontidae (Гастромизоновые)
- Семейство Gobionidae (Пескаревые)
- Семейство Gyrinocheilidae (Гиринохейловые)
- Семейство Leptobarbidae (Лептобарбусовые)
- Семейство Leuciscidae (Ельцовые)
- Семейство Nemacheilidae (Гольцовые)
- Семейство Paedocyprididae (Паедоциприсовые)
- Семейство Psilorhynchidae (Псилоринховые)
- Семейство Serpenticobitidae (Серпентикобитисовые)
- Семейство Sundadanionidae (Сандаданиевые)
- Семейство Tanichthydae (Кардиналовые)
- Семейство Tincidae (Линевые)
- Семейство Vaillantellidae (Вайлантелливые)
- Семейство Xenocypridae (Ксеноциприевые)
Отряд Cyprinodontiformes (Карпозубоообразные)
- Семейство Anablepidae (Четырехглазые)
- Семейство Aplocheilidae (Аплохейлиевые)
- Семейство Cyprinodontidae (Карпозубые)
- Семейство Fundulidae (Фундуловые)
- Семейство Goodeidae (Гудиевые)
- Семейство Nothobranchiidae (Нотобранхиевые)
- Семейство Poeciliidae (Пецилиевые)
- Семейство Profundulidae (Профундуловые)
- Семейство Rivulidae (Ривулувые)
- Семейство Valenciidae (Валенсиевые)
Отряд Elopiformes (Тарпонообразные)
- Семейство Elopidae (Элопсовые)
- Семейство Megalopidae (Мегалопсовые)
Отряд Esociformes (Щукообразные)
- Семейство Esocidae (Щуковые)
- Семейство Umbridae (Умбровые)
Отряд Hiodontiformes (Луноглазообразные)
- Семейство Hiodontidae (Луноглазые)
Отряд Gadiformes (Трескообразные)
- Семейство Gadidae (Тресковые)
Отряд Gasterosteiformes (Колюшкообразные)
- Семейство Gastrosteidae (Колюшковые)
- Семейство Indostomidae (Индостомовые)
- Семейство Syngnathidae (Игловидные)
Отряд Gobiesociformes (Присоскообразные)
- Семейство Gobiesocadae (Колбнещуковые)
Отряд Gobiiformes (Бычковидные)
- Семейство Butidae (Бутиевые)
- Семейство Eleotridae (Элеотрисовые)
- Семейство Gobiidae (Бычковидные)
- Семейство Melyerngidae (Милеринговые)
- Семейство Odontobutidae (Одонтобутовые)
- Семейство Oxudercidae (Оксудерцидеевые)
- Семейство Rhyacichthyidae (Риацихтивые)
- Семейство Thalasseleotridae (Талассэлеотрисовые)
Отряд Gonorynchiformes (Гоноринхообрзные)
- Семейство Chanidae (Ханидовые)
- Семейство Kneriidae (Кнериевые)
- Семейство Phractolemidae (Фрактолемовые)
Отряд Gymnotiformes (Гимнотообразные)
- Семейство Apteronotidae (Аптеноротовые)
- Семейство Electrophoridae (Электрические угри)
- Семейство Gymnotidae (Гимнотовые)
- Семейство Hypopomidae (Гипопомовые)
- Семейство Rhamphichthyidae (Рамфихтовые)
- Семейство Sternopygidae (Стернопиговые)
Отряд Kurtiformes (Куртиобразные)
- Семейство Apogonidae (Апогоновые)
- Семейство Kurtidae (Куртовые)
Отряд Mugiliformes (Кефалеобразные)
- Семейство Mugilidae (Кефалевые)
Отряд Ophidiiformes (Офидиеобразные)
- Семейство Bythitidae (Битиевые)
Отряд Osmeriformes (Корюшкообразные)
- Семейство Galaxiidae (Галаксиевые)
- Семейство Osmeridae (Корюшковые)
- Семейство Plecoglossidae (Плекоглоссовые)
- Семейство Retropinnidae (Ретропиновые)
- Семейство Salangidae (Саланговые)
Отряд Osteoglossiformes (Арованообразные)
- Семейство Gymnarchidae (Гимнарховые)
- Семейство Mormyridae (Слонорылые)
- Семейство Osteoglossidae (Аровановые)
- Семейство Pantodontidae (Пантодоновые)
Отряд Perciformes (Окунеобразные)
- Семейство Ambassidae (Стеклянные окуни)
- Семейство Centropomidae (Центропомовые)
- Семейство Cheimarrichthyidae (Хеимарихтовые)
- Семейство Embiotocidae (Эмбиотовые)
- Семейство Gerreidae (Герриевые)
- Семейство Heumulidae (Хумилиевые)
- Семейство Latidae (Латиевые)
- Семейство Leptobramidae (Лептобрамовые)
- Семейство Lutjanidae (Луциановые)
- Семейство Monodactylidae (Однопалые)
- Семейство Moronidae (Мороновые)
- Семейство Percidae (Окуневые)
- Семейство Pinguipedidae (Пингупиевые)
- Семейство Polycentridae (Полицентровые)
- Семейство Polymidae (Полимиевые)
- Семейство Pseudaphridae (Псевдофриевые)
- Семейство Sciaenidae (Сциановые)
- Семейство Serranidae (Каменные окуни)
- Семейство Sillaginidae (Силлаговые)
- Семейство Sparidae (Спаровые)
- Семейство Stichaeidae (Стихаевые)
- Семейство Toxotidae (Брызгуновые)
- Семейство Zoarcidae (Бельдюговые)
Отряд Percopsiformes (Перкопсообразные)
- Семейство Aphredoderidae (Афредовые)
- Семейство Amblyopsidae (Слепоглазковые)
- Семейство Percopsidae (Лососеокуневые)
Отряд Pleuronectiformes (Камбалообразные)
- Семейство Achiridae (Ахировые)
- Семейство Cynoglossidae (Циноглосовые)
- Семейство Paralichthyidae (Паралихтовые)
- Семейство Pleuronectidae (Камбаловые)
- Семейство Soleidae (Солеивые)
Отряд Salmoniformes (Лососеобразные)
- Семейство Coregonidae (Сиговые)
- Семейство Salmonidae (Лососевые)
- Семейство Thymallidae (Хариусовые)
Отряд Scombriformes (Скумбриобразные)
- Семейство Scombroidae (Скумбриевые)
Отряд Scorpaeniformes (Скорпенообразные)
- Семейство Abyssocottidae (Абиссокотовые)
- Семейство Comephoridae (Голомянковые)
- Семейство Cottidae (Керчаковые)
- Семейство Tetrarogidae (Тетрароговые)
Отряд Siluriformes (Сомообразные)
- Семейство Akysidae (Акисовые)
- Семейство Ailiidae (Алиевые)
- Семейство Amblycipitidae (Толстохвостые)
- Семейство Amphilidae (Амфилиевые)
- Семейство Anchariidae (Анхариевые)
- Семейство Ariidae (Ариевые)
- Семейство Aspredinidae (Широкоголовые)
- Семейство Astroblepidae (Астроблеповые)
- Семейство Auchenipteridae (Затылкоперые)
- Семейство Austroglanidae (Астрогланиевые)
- Семейство Bagridae (Касатковые)
- Семейство Callichthyidae (Панцирные)
- Семейство Cetopsidae (Китовые)
- Семейство Chacidae (Хаковые)
- Семейство Clariidae (Лабиринтовые)
- Семейство Claroteidae (Кларотеевые)
- Семейство Cranoglanidae (Бычьи)
- Семейство Diplomystidae (Дипломистовые)
- Семейство Doradidae (Броняковые)
- Семейство Erethistidae (Харовые)
- Семейство Heptepteridae (Гептатеридовые)
- Семейство Heteropneustidae (Мешкожаберные)
- Семейство Horabagridae (Хорабагровые)
- Семейство Ictaluridae (Кошачьи)
- Семейство Kryptoglanidae (Криптогланиевые)
- Семейство Lacantuniidae (Лакантовые)
- Семейство Loricariidae (Кольчужные)
- Семейство Malapteruidae (Электрические)
- Семейство Mochokidae (Бахрамчатоусые)
- Семейство Nematogenyiidae (Нематогенеевые)
- Семейство Pangasiidae (Акульи)
- Семейство Pimelodidae (Плоскоголовые)
- Семейство Plotosidae (Морские)
- Семейство Pseudopimelodidae (Псевдопимелодовые)
- Семейство Schilbeidae (Шильбовые)
- Семейство Scoloplacidae (Сколоплаксовые)
- Семейство Siluridae (Сомовые)
- Семейство Sisoridae (Багариевые)
- Семейство Trichomycteridae (Паразитические)
Отряд Synbranchiformes (Слиткожаберниковые)
- Семейство Chaudhuriidae (Хаудхуровые)
- Семейство Mastacembelidae (Хоботонорылые)
- Семейство Synbrachidae (Ложноугревые)
Отряд Tetraodontiformes (Четырехзубообразные)
- Семейство Tetradontidae (Четырехзубые)
*В систематике приведены все существующие отряды и семейства, в которых есть пресноводные рыбы или рыбы, образ жизни которых связан с пресной водой.
**Представители семейства Nemacheilidae, Barbuccidae и Vaillantellidae помещены в семейство Balitoridae, а семейство Serpenticobitidae в семейство Cobitidae по старой классификации.
***В данной классификации опущены (упрощенный вариант) некоторые таксоны: тип, надотряд, подотряд, подсемейство и т.д.
****В последнее время появилось много отрядов и семейств. В основном много отрядов было выведено из отряда Окунеобразные.